Война против Бухары и договор 1868 года

После взятия Ташкента российское правительство планировало завоёвывать ханства по одному и следовало принципу «разделяй и властвуй», направленному на то, чтобы не дать им объединиться. Черняев был отозван из Ташкента, а губернатором Туркестанской области стал Ф. Романовский; заявив, что Бухара готовится к войне против России, он попросил разрешения выступить в поход. В мае 1866 года близ селения Ирджар войско эмира было разбито, потому что силы были неравны. Затем крепость Худжанд была осаждена и обстреляна и пала в конце мая; многие защитники и мирные жители были убиты. Оренбургский генерал-губернатор Н. Крыжановский потребовал от эмира контрибуцию в 100 тысяч рублей, а когда срок прошёл, наступление продолжилось. Осенью 1866 года была взята Ура-Тюбе, а 18 октября (по старому стилю) пал Джизак; помощь из Бухары пришла поздно. Из земель, взятых в 1864–1866 годах, была образована Сырдарьинская область.